Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8K3

Srsf12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf12Q8C8K3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf12Q8C8K3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf12Q8C8K3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf12Q8C8K3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf12Q8C8K3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf12Q8C8K3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms