Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apol9bQ8C7I4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apol9bQ8C7I4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apol9bQ8C7I4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apol9bQ8C7I4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Apol9bQ8C7I4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms