Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf428Q8C1M2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf428Q8C1M2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Znf428Q8C1M2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Znf428Q8C1M2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Znf428Q8C1M2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Znf428Q8C1M2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Znf428Q8C1M2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Znf428Q8C1M2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms