Protein–RNA interactions for Protein: Q8C084

Snx22, Sorting nexin 22, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx22Q8C084 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx22Q8C084 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx22Q8C084 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx22Q8C084 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx22Q8C084 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms