Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bicd1Q8BR07 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Bicd1Q8BR07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bicd1Q8BR07 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bicd1Q8BR07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bicd1Q8BR07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bicd1Q8BR07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bicd1Q8BR07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bicd1Q8BR07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms