Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU6

Gjc2, Gap junction gamma-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc2Q8BQU6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjc2Q8BQU6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjc2Q8BQU6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjc2Q8BQU6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjc2Q8BQU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjc2Q8BQU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjc2Q8BQU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms