Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop53Q8BK35 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nop53Q8BK35 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nop53Q8BK35 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nop53Q8BK35 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nop53Q8BK35 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms