Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28,88■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Slfnl1Q8BHW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Slfnl1Q8BHW9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Slfnl1Q8BHW9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Slfnl1Q8BHW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Slfnl1Q8BHW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28,56■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Slfnl1Q8BHW9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,8 ms