Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH04

Pck2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pck2Q8BH04 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pck2Q8BH04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pck2Q8BH04 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pck2Q8BH04 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pck2Q8BH04 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms