Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Htatsf1Q8BGC0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Htatsf1Q8BGC0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Htatsf1Q8BGC0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Htatsf1Q8BGC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Htatsf1Q8BGC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms