Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc12Q80WJ6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Abcc12Q80WJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Abcc12Q80WJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Abcc12Q80WJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Abcc12Q80WJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Abcc12Q80WJ6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Abcc12Q80WJ6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Abcc12Q80WJ6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Abcc12Q80WJ6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms