Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LnpkQ7TQ95 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LnpkQ7TQ95 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LnpkQ7TQ95 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LnpkQ7TQ95 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LnpkQ7TQ95 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LnpkQ7TQ95 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms