Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stambpl1Q76N33 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stambpl1Q76N33 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stambpl1Q76N33 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stambpl1Q76N33 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stambpl1Q76N33 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stambpl1Q76N33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms