Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Med16Q6PGF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Med16Q6PGF3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Med16Q6PGF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Med16Q6PGF3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Med16Q6PGF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms