Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms