Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Soga3Q6NZL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Soga3Q6NZL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Soga3Q6NZL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Soga3Q6NZL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Soga3Q6NZL0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Soga3Q6NZL0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms