Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sohlh1Q6IUP1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sohlh1Q6IUP1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sohlh1Q6IUP1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sohlh1Q6IUP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sohlh1Q6IUP1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sohlh1Q6IUP1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sohlh1Q6IUP1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sohlh1Q6IUP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sohlh1Q6IUP1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms