Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tpm4Q6IRU2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tpm4Q6IRU2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tpm4Q6IRU2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tpm4Q6IRU2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tpm4Q6IRU2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms