Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Cep170Q6A065 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cep170Q6A065 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Cep170Q6A065 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Cep170Q6A065 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Cep170Q6A065 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Cep170Q6A065 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Cep170Q6A065 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cep170Q6A065 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms