Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms