Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CltcQ68FD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CltcQ68FD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CltcQ68FD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CltcQ68FD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CltcQ68FD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CltcQ68FD5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CltcQ68FD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms