Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp4fQ66X05 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp4fQ66X05 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4fQ66X05 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4fQ66X05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4fQ66X05 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4fQ66X05 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4fQ66X05 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4fQ66X05 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms