Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp2a3Q64518 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atp2a3Q64518 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp2a3Q64518 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp2a3Q64518 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms