Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Phc1Q64028 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Phc1Q64028 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phc1Q64028 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phc1Q64028 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phc1Q64028 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms