Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SypQ62277 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SypQ62277 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SypQ62277 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SypQ62277 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SypQ62277 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SypQ62277 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SypQ62277 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SypQ62277 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SypQ62277 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SypQ62277 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SypQ62277 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SypQ62277 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SypQ62277 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SypQ62277 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SypQ62277 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SypQ62277 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SypQ62277 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SypQ62277 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SypQ62277 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SypQ62277 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SypQ62277 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SypQ62277 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms