Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
Kdm5dQ62240 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.43■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
Kdm5dQ62240 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
Kdm5dQ62240 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Kdm5dQ62240 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC44.21■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.67
Kdm5dQ62240 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Kdm5dQ62240 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
Kdm5dQ62240 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Kdm5dQ62240 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Kdm5dQ62240 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms