Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx3xQ62167 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx3xQ62167 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx3xQ62167 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx3xQ62167 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms