Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Npm1Q61937 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Npm1Q61937 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Npm1Q61937 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Npm1Q61937 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Npm1Q61937 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Npm1Q61937 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Npm1Q61937 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Npm1Q61937 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms