Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Gli3Q61602 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Gli3Q61602 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Gli3Q61602 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gli3Q61602 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Gli3Q61602 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gli3Q61602 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Gli3Q61602 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gli3Q61602 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gli3Q61602 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms