Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EsrrbQ61539 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EsrrbQ61539 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EsrrbQ61539 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EsrrbQ61539 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms