Protein–RNA interactions for Protein: Q60948

Mxd4, Max dimerization protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mxd4Q60948 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mxd4Q60948 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mxd4Q60948 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mxd4Q60948 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mxd4Q60948 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mxd4Q60948 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mxd4Q60948 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mxd4Q60948 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mxd4Q60948 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mxd4Q60948 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms