Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Atf3Q60765 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Atf3Q60765 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Atf3Q60765 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Atf3Q60765 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Atf3Q60765 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Atf3Q60765 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms