Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd5Q5VCS6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd5Q5VCS6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd5Q5VCS6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms