Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdcp1Q5U462 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdcp1Q5U462 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdcp1Q5U462 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdcp1Q5U462 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdcp1Q5U462 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152 ms