Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PfplQ5RKV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PfplQ5RKV8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PfplQ5RKV8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PfplQ5RKV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PfplQ5RKV8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PfplQ5RKV8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfplQ5RKV8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfplQ5RKV8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PfplQ5RKV8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms