Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh12Q5RJH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh12Q5RJH3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdh12Q5RJH3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdh12Q5RJH3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms