Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam208bQ5DTT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam208bQ5DTT3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam208bQ5DTT3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam208bQ5DTT3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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