Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Scn2bQ56A07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Scn2bQ56A07 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scn2bQ56A07 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scn2bQ56A07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scn2bQ56A07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms