Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prune2Q52KR3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Prune2Q52KR3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prune2Q52KR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prune2Q52KR3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prune2Q52KR3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms