Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm5935Q497S0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm5935Q497S0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm5935Q497S0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm5935Q497S0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm5935Q497S0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms