Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0B4

Cfap65, Cilia- and flagella-associated protein 65, mousemouse

Predictions only

Length 1,847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap65Q3V0B4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cfap65Q3V0B4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cfap65Q3V0B4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Cfap65Q3V0B4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cfap65Q3V0B4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cfap65Q3V0B4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cfap65Q3V0B4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cfap65Q3V0B4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms