Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cep63Q3UPP8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep63Q3UPP8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep63Q3UPP8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep63Q3UPP8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep63Q3UPP8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 544.8 ms