Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIV5

Zc3h15, Zinc finger CCCH domain-containing protein 15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h15Q3TIV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zc3h15Q3TIV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Zc3h15Q3TIV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Zc3h15Q3TIV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zc3h15Q3TIV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zc3h15Q3TIV5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zc3h15Q3TIV5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms