Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne9Q1RLL3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cpne9Q1RLL3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cpne9Q1RLL3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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