Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Perm1Q149B8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Perm1Q149B8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Perm1Q149B8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Perm1Q149B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Perm1Q149B8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Perm1Q149B8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms