Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 RPL2BYIL018W 765 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 YLL066CYLL066C 3618 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 ADE17YMR120C 1779 nt7.45□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 YGL260WYGL260W 231 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 MCH2YKL221W 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 ATP2YJR121W 1536 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 YKL147CYKL147C 618 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 ERV25YML012W 636 nt7.43□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 OPI11YPR044C 354 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 TKL2YBR117C 2046 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 GSH1YJL101C 2037 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 YDR327WYDR327W 327 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 CAR2YLR438W 1275 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 MTR3YGR158C 753 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 RPR1RPR1 369 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 COS10YNR075W 1125 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC39Q12745 HXT8YJL214W 1710 nt7.4□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 VBA5YKR105C 1749 nt7.4□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 BDF2YDL070W 1917 nt7.4□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 FCY22YER060W-A 1593 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YBR241CYBR241C 1467 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YAL045CYAL045C 309 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 PMU1YKL128C 888 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 BIM1YER016W 1035 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YAH1YPL252C 519 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 GPH1YPR160W 2709 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 ARP3YJR065C 1350 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 ERS1YCR075C 783 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 HSP12YFL014W 330 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 DST1YGL043W 930 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YLR358CYLR358C 564 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YNL200CYNL200C 741 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YHR033WYHR033W 1272 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YIL168WYIL168W 384 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 SNT309YPR101W 528 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 RHO1YPR165W 630 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 AVT4YNL101W 2142 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 PHO3YBR092C 1404 nt7.35□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 NMD5YJR132W 3147 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 TAH11YJR046W 1815 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 PSP2YML017W 1782 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 SUR7YML052W 909 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC39Q12745 YDR215CYDR215C 414 nt7.33□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 MNN9YPL050C 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 CRN1YLR429W 1956 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 PUP3YER094C 618 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 SHC1YER096W 1539 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 HXT2YMR011W 1626 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 PUP2YGR253C 783 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 YPL041CYPL041C 624 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 KNS1YLL019C 2214 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 URA1YKL216W 945 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 YML079WYML079W 606 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 CPT1YNL130C 1182 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 YPC1YBR183W 951 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 CCT3YJL014W 1605 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 CEF1YMR213W 1773 nt7.29□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 THI73YLR004C 1572 nt7.29□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 LAT1YNL071W 1449 nt7.28□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 HAC1YFL031W 717 nt7.28□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 PRE10YOR362C 867 nt7.28□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 AMN1YBR158W 1650 nt7.28□□□□□ -1.24
SEC39Q12745 OPI8YKR035C 642 nt7.27□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 DAL7YIR031C 1665 nt7.27□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 SPR1YOR190W 1338 nt7.26□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 ISC1YER019W 1434 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 TIM50YPL063W 1431 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 UBP13YBL067C 2244 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 HBN1YCL026C-B 582 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 YBR284WYBR284W 2394 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 YUR1YJL139C 1287 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 CEM1YER061C 1329 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 ERG24YNL280C 1317 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 YLL058WYLL058W 1728 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 YKR023WYKR023W 1593 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 QCR6YFR033C 444 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 PIH1YHR034C 1035 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 PNS1YOR161C 1620 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC39Q12745 COX16YJL003W 357 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YNR014WYNR014W 639 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 JHD1YER051W 1479 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 ASN2YGR124W 1719 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YIP4YGL198W 708 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 DAL80YKR034W 810 nt7.2□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 RAP1YNL216W 2484 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 DPH5YLR172C 903 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YOX1YML027W 1158 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YIL055CYIL055C 1884 nt7.19□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 RIO1YOR119C 1455 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 MRPL28YDR462W 444 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 IRC5YFR038W 2562 nt7.18□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 ERP2YAL007C 648 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 ATP23YNR020C 813 nt7.17□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 SUN4YNL066W 1263 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YOR300WYOR300W 309 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 RPL5YPL131W 894 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 ARG7YMR062C 1326 nt7.16□□□□□ -1.26
SEC39Q12745 YOS9YDR057W 1629 nt7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms