Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Vps8Q0P5W1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Vps8Q0P5W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33,89■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Vps8Q0P5W1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,88■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3,01
Vps8Q0P5W1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33,82■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33,79■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33,78■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33,78■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Vps8Q0P5W1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Vps8Q0P5W1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms