Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnn1Q08091 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnn1Q08091 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnn1Q08091 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnn1Q08091 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms