Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Aplp2Q06335 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Aplp2Q06335 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Aplp2Q06335 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Aplp2Q06335 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Aplp2Q06335 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Aplp2Q06335 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Aplp2Q06335 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Aplp2Q06335 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Aplp2Q06335 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Aplp2Q06335 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms