Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 THI4YGR144W 981 nt5.71□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 DLD1YDL174C 1764 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 PEX13YLR191W 1161 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 YOL099CYOL099C 492 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 ATG22YCL038C 1587 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 CSC1YLR241W 2349 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 VHT1YGR065C 1782 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 BDS1YOL164W 1941 nt5.7□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 RGD2YFL047W 2145 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 PEX31YGR004W 1389 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 KTR5YNL029C 1569 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 TAF13YML098W 504 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 CUE4YML101C 354 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 ADH5YBR145W 1056 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 BRN1YBL097W 2265 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 KEL1YHR158C 3495 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 PGI1YBR196C 1665 nt5.69□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 FRE5YOR384W 2085 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 YPR204WYPR204W 3099 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 NCA3YJL116C 1014 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 YMR074CYMR074C 438 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 JHD1YER051W 1479 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 TPO3YPR156C 1869 nt5.68□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 ICS3YJL077C 396 nt5.67□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 RMD9YGL107C 1941 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 CAK1YFL029C 1107 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 PHB2YGR231C 933 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 ADH3YMR083W 1128 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 TUF1YOR187W 1314 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 SES1YDR023W 1389 nt5.66□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 STE3YKL178C 1413 nt5.65□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 NAF1YNL124W 1479 nt5.65□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 SKI2YLR398C 3864 nt5.65□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 GET2YER083C 858 nt5.65□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 YML6YML025C 861 nt5.65□□□□□ -1.5
CUE4Q04201 PXL1YKR090W 2121 nt5.65□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 MSG5YNL053W 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 PAC2YER007W 1557 nt5.64□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 THR1YHR025W 1074 nt5.64□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YJR107WYJR107W 987 nt5.64□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 SLX5YDL013W 1860 nt5.64□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 MOB1YIL106W 945 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 PMU1YKL128C 888 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 GCN3YKR026C 918 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 CCP1YKR066C 1086 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 DUS4YLR405W 1104 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 COX5AYNL052W 462 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 PET494YNR045W 1470 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YPL247CYPL247C 1572 nt5.63□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.62□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 OAC1YKL120W 975 nt5.62□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YNL295WYNL295W 1575 nt5.62□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YDR387CYDR387C 1668 nt5.62□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 ESC8YOL017W 2145 nt5.62□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 ALT2YDR111C 1524 nt5.61□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 CTA1YDR256C 1548 nt5.61□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 HIS1YER055C 894 nt5.61□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 ERG27YLR100W 1044 nt5.61□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 INP54YOL065C 1155 nt5.61□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 CDD1YLR245C 429 nt5.6□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 COX9YDL067C 180 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YKR032WYKR032W 315 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 YLR280CYLR280C 351 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 RPL43AYPR043W 279 nt5.59□□□□□ -1.51
CUE4Q04201 AFG1YEL052W 1530 nt5.58□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 HAS1YMR290C 1518 nt5.58□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 PUS7YOR243C 2031 nt5.58□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 YMR166CYMR166C 1107 nt5.58□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 SER2YGR208W 930 nt5.57□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 TOS6YNL300W 309 nt5.57□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 YDR514CYDR514C 1452 nt5.57□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 DAL7YIR031C 1665 nt5.56□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 GPI11YDR302W 660 nt5.56□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 HPT1YDR399W 666 nt5.55□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 ATP23YNR020C 813 nt5.55□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 MTC5YDR128W 3447 nt5.54□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 RRP43YCR035C 1185 nt5.54□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 YPT10YBR264C 600 nt5.54□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 YDR415CYDR415C 1125 nt5.53□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 RRT14YIL127C 621 nt5.53□□□□□ -1.52
CUE4Q04201 STB5YHR178W 2232 nt5.52□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 BZZ1YHR114W 1902 nt5.52□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 PMT3YOR321W 2262 nt5.52□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 SRP102YKL154W 735 nt5.52□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 TRS31YDR472W 852 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 RPS28AYOR167C 204 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 MOD5YOR274W 1287 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 YEN1YER041W 2280 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 MIP1YOR330C 3765 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 CRP1YHR146W 1398 nt5.51□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 YML133CYML133C 4125 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 MRC1YCL061C 3291 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 SAC6YDR129C 1929 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 PYK2YOR347C 1521 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 NMT1YLR195C 1368 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 SPS1YDR523C 1473 nt5.5□□□□□ -1.53
CUE4Q04201 HSP150YJL159W 1242 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms